раскажите чего означают циферки в таблице альянса в столбике очки

Строительный рейтинг.

Т.е. стоимость всех построенных зданий на всех сотах данного соальянсника, в пересчете на продиум.

а если рейт отрицательный

Хм.. не уверен точно, но возможно это может проявиться тогда, когда переехал из мира в мир(рейтинг обнуляется до первого строительства здания) и потом вы снесли какое-то здание...