Предлагаю ввести новое сооружение. Обогатительная фабрика артов.
Помещаешь артефакт в это сооружение и с верояностью n% он меняет свой цвет на следующий более высокий или с вероятностью (100-n)% разрушается и исчезает. Величину N можно даже менять в зависимости от уровня науки, что бы интересней было. Для того что бы не было полной халявы такая фабрика должна обрабатывать арт достаточно длительное время (например сутки или двое) время можно сделать в зависимости от цвета артефакта. Тогда здание можно сделать не уникальным. Просто затраты обработки артов будет зависеть от объема отчужденной территории на которой могли бы стоять например заводы по производству када или наны.

Этот вариант становиться альтернативой уничтожению или продажи ненужных артов.

Можно сделать проще, по аналогии с другими играми: ставишь в фабрику 10 постоянных крохотных артефактов и в результате обработки появляется аналогичный вставленным 10 но один временный арт на уровень выше, к примеру из 10 крохотных постоянных один малый временный. Причем копаться должны только постоянные арты, а результатом преобразования будут являться временные, причем временные арты тоже можно преобразовывать.
Правда это может привести к тому что игроки начнут копить арты для преобразования.