К примеру малое хранилище энергии сохраняет энергию произведенную за 4 часа
собственно вопрос произведення? это которая:
-базовое производство(только здания)
-продукция с бонусами
-итоговое производство (после вычета потребления)??

хотелось бы знать наверняка

Будет сохранять продукцию с бонусами за последние N часов.

И если поставить 2 хранилища, будут они сохранять ресурсы за 4+4=8 часов?

хранилище сохраняет добычу за N часов, и его можно построить только 1 на каждый ресурс.
склад сохраняет N ресурсов, но ими можно застроить весь песок, при этом кол-во сохраняемых ресурсов суммируется